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真核转录组测序

产品简介

转录组测序(Transcriptome Sequencing)是对某一物种特定时间点或特定条件下的mRNA进行高通量测序。转录组测序能够动态反映基因的转录水平,同时可鉴定和定量稀有转录本和正常转录本,并且提供样品特异的转录本序列结构信息。

研究内容

   

有参考基因组 

   

无参考基因组

1) 与参考基因组比对;

2) 基因结构优化;

3) 新转录本预测;

4) 可变剪接分析;

5) SNP、Indel分析;

6) 转录组因子分析;

1) 转录组本拼接;

2) Unigene功能注释;

3) CDS预测;

4) SNP分析;

5) SSR分析;

6) 转录组因子分析;

7) 样品相关性分析;

8) 基因表达水平分析;

9) 基因表达差异分析;

10) 差异基因功能富集分析;

11) 蛋白互作网络分析;

12) 分析结果可视化。

7) 样品间相关性分析;

8) 基因表达水平分析;

9) 基因表达差异分析;

10) 差异基因功能富集分析;

11) 蛋白互作网络分析;

12) 分析结果可视化。

结果展示

送样建议

1) 样品类型:总RNA;

2) 样品浓度:≥50ng/?g;

3) RNA总量:≥1?g;

4) RNA纯度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260处有正常峰值;

5) RNA完整度:电泳检测28s/18s≥1.5或RIN≥6.8(动物)、6.3(植物、真菌),基线平整(软体等无28S物种)。

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