产品简介

长链非编码RNA测序（lncRNA Sequencing）是一种使用特定方法降低样本中rRNA丰度，对富集到的RNA进行文库构建，再对测序数据进行信息分析的研究方法。可一次获得样本中几乎全部的lncRNA信息，对lncRNA的类别、功能进行全方位深入分析，从而快速全面准确地获得与特定生物学过程相关的lncRNA的信息。

研究内容

1) 测序质量值分布统计；

2) 测序数据产出统计；

3) 与参考基因组比对分析；

4) RNA-Seq整体质量评估：Insert长度检验；测序随机性分析；测序饱和度分析；

5) 转录本拼接；

6) 已知lncRNA比对分析与统计；

7) 候选lncRNA基本筛。

8) class_code的分布；

9) 候选lncRNA编码潜能筛。–PC、CNCI分析，pfam蛋白结构域分析，编码潜能预测维恩图）；

10) 最终过滤结果管道图；

11) lncRNA靶基因预测（trans和cis作用）；

12)  lncRNA表达定量分析；

13) lncRNA差异表达分析；

14) 样品间lncRNA相关性分析（含生物学重复样品）；

15)Cis作用差异lncRNA靶基因注释富集分析；

16)Cis作用差异lncRNA靶基因PPI分析；

17)Trans作用差异lncRNA靶基因注释富集分析；

18) Trans作用差异lncRNA靶基因PPI分析；

19)mRNA基因表达定量；

20)重复相关性检测（有生物学重复）；

21) 差异表达基因筛。礁龌蛞陨涎罚

22) 差异表达基因聚类分析（两个或以上样品）；

23)差异表达基因的功能注释（两个或以上样品）；

24)差异表达基因的GO和KEGG富集分析（两个或以上样品）；

25)差异表达基因蛋白互作网络；

26)lncRNA与mRNA表达水平比较；

结果展示

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