产品简介
完整的转录本包括了从5’端到3’端polyA尾的序列，长度集中分布在1-6kb。二代测序技术由于读长较短，得到的测序片段需要拼接，得到的转录本可能会产生拼接错误和较多的嵌合体，从而不能得到完整的转录本。第三代测序技术Pacbio利用单分子实时测序技术（SMRT），由于其超长的读长（平均15kb），无需拼接即可直接获取完整的全长转录本，因此可得到更高质量的转录本，有利于mRNA结构的研究，如可变剪切、融合基因、等位基因表达等。
研究内容
|
有参全长转录组分析内容 |
无参全长转录组分析内容 |
|
|
1) 数据质控、转录本分类； 2) 转录本聚类与校正； 3) 与参考基因组比对； 4) 进行可变剪切分析； 5) 新基因预测； 6) 融合基因分析； 7) 作为参考序列，定量分析； 8) 编码蛋白框预测； 9) lncRNA预测。 |
|
1) 数据质控、转录本分类； 2) 转录本聚类与校正； 3) 七大转录本数据库注释； 4) 作为参考序列、定量分析； 5) lncRNA预测； 6) 编码蛋白框预测。
|
结果展示
送样建议
1) 样品类型：组织样或总RNA；
2) 样品浓度：≥300ng/?g；
3) RNA总量：≥10?g；
4) RNA纯度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260处有正常峰值；
5) RNA完整度：电泳检测28s/18s≥1.5或RIN≥8，基线平整（软体等无28S物种）。