产品简介

宏基因组是指特定环境中全部微生物遗传物质的总和，宏基因组测序以特定环境中全部微生物群落作为研究的对象，提取环境微生物总DNA进行测序及分析；宏基因组摆脱了传统微生物研究中分离培养的技术限制，在基因组水平解读微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系。
研究内容

1) 数据质控
2) 基因组组装及基因预测
3) 物种注释
   各分类水平上物种丰度图；Alpha多样性分析；样品间差异组成PCA分析；
4) 基因组分预测
   基因预测；转座元件预测；前噬菌体预测
5) 基因功能注释
   基因家族分类；通用数据库注释：GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam；专用数据库注释；
6) 多样品比较分析
   筛选与样品分组显著相关因子（基因、功能）；基于筛选因子对样品进行主成分分析（PCA）；基于筛选因子对样品进行  聚类分析。
结果展示

送样建议

1、一般以土壤、水体、肠道、根际等微生物为研究对象；
2、样品选取需要以时间、地域、深度、部位等为参考，建议每个样品设置3个以上生物学重复；
3、DNA要求：总量≥150ng，浓度≥50ng/?l，OD260/280：1.8-2.0，电泳要求：主带清晰，无降解或轻度降解；
4、组织样要求：土壤、根系等固体样本约1-3g；菌液样本需离心取沉淀物，不少于50mg；