产品简介

基因组从头组装（denovo）是指在不依赖参考基因组的情况下对真/细菌进行基因组测序及拼接组装，从而绘制该物种的全基因组序列图谱。真菌及细菌基因组一般较小，真菌在100M内，采用三代测序技术可组装出较高质量基因组。

研究内容

1) 数据质控
2) 基因组组装；
3) 基因组情况评估
4) 基因组组分分析：
    编码基因预测；重复序列注释；非编码RNA预测；假基因分析
6) 基因功能注释：
    通用数据库注释：GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam；
7) 分泌蛋白分析；各专用数据库注释

8) 比较基因银河国际·Galaxy分析

结果展示

送样建议

1、真菌需纯培养以避免杂菌污染，菌丝量200mg以上；
2、DNA要求：总量≥10ug，浓度≥50ng/?l，OD260/280：1.8-2.0，电泳要求：主带清晰，无降解或轻度降解；